基因研究證實新冠病毒并非來自華南海鮮市場
1月27日，Science在線發(fā)表了一篇新聞報道，有研究人員推測新型冠狀病毒可能并非源自華南海鮮市場。理由是，最初的一個病例在12月1日患病，但與華南海鮮市場無關(guān)。
如今，這個推測被中國科學(xué)家最新的基因研究成果所證實。相關(guān)研究已發(fā)表在中國科學(xué)院科技論文預(yù)發(fā)布平臺ChinaXiv。
截止2月12日，中國科學(xué)院西雙版納熱帶植物園聯(lián)合華南農(nóng)業(yè)大學(xué)和北京腦科中心的科研人員一起收集了全世界各領(lǐng)域共享到GISAID EpiFluTM數(shù)據(jù)庫中覆蓋了四大洲12個國家的93個新型冠狀病毒樣本的基因組數(shù)據(jù)，通過全基因組數(shù)據(jù)解析，追溯傳染源及擴散路徑。研究結(jié)果發(fā)現(xiàn)：
新型冠狀病毒并非來自武漢華南海鮮市場
研究收到的93個樣本包含58種單倍型，單倍型演化關(guān)系顯示，單倍型H13和H38是比較“古老的”單倍型，通過一個中間載體（mv1，可能是一個祖先單倍型，可能是來自中間宿主或者“零號病人”）與蝙蝠冠狀病毒RaTG13關(guān)聯(lián)，并通過單倍型H3衍生出了單倍型H1。
與華南海鮮市場有關(guān)聯(lián)的患者樣品單倍型都是H1及其衍生的單倍型H2、H8-H12，而一份武漢樣品單倍型H3與華南海鮮市場無關(guān)。可見，華南海鮮市場的新型冠狀病毒是從其他地方傳入進來，在市場中發(fā)生快速傳播蔓延到市場之外。
新冠病毒發(fā)生過2次明顯的種群擴張
根據(jù)新型冠狀病毒基因組發(fā)生重組時間推算，1月之前的種群擴張發(fā)生時間是12月8日。這一結(jié)果也暗示了，病毒可能在12月初，甚至11月下旬已經(jīng)開始有人際傳播，隨后在華南海鮮市場加快了人際傳播。
另一次種群擴張發(fā)生在1月6日，這可能與元旦假期有關(guān)聯(lián)。也是在這一天，國家疾控中心發(fā)布了2級應(yīng)急響應(yīng)。當(dāng)時的預(yù)警起到了一些警示作用，公眾活動和出行都有所減少。如果當(dāng)時的警示能引起大眾更廣泛的重視，那么1月份中下旬向全國和全球蔓延的病例會有所降低。
該研究進一步確認(rèn)了，我國其他9個省區(qū)和其他11個國家的感染病例基本都是從武漢直接或者間接輸入而來。
現(xiàn)擴散的病例至少來自于3個途徑
為了能夠細(xì)分來源，研究人員將58種單倍型分成了五組，包括3個古老超級傳播者單倍型（H1, H3和H13）和2個新的超級傳播者單倍型（H56和mv2）。
以此鑒別出廣東的病毒可能有三個來源，重慶和中國臺灣的病毒有兩個來源。其中，廣東深圳一家人在早期就通過人傳人進行了傳播。澳大利亞、法國、日本、美國的樣本相對較多，這些患者感染源至少有兩個，而美國甚至包括了五個來源。
特別值得關(guān)注的是H56這個超級傳播者單倍型，它同時是澳大利亞、法國、美國，以及中國臺灣患者的傳染源。
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